Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2L6

Nsd3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsd3Q6P2L6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nsd3Q6P2L6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Nsd3Q6P2L6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nsd3Q6P2L6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nsd3Q6P2L6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms