Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ4

Paxip1, PAX-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxip1Q6NZQ4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Paxip1Q6NZQ4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Paxip1Q6NZQ4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Paxip1Q6NZQ4 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Paxip1Q6NZQ4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms