Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32,24■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32,23■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32,23■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,23■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,22■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32,21■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,21■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC32,21■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32,2■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32,2■■■□□ 2,75
SphkapQ6NSW3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,2■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32,2■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32,19■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,19■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32,18■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC32,17■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,17■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32,17■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32,16■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32,16■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32,16■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC32,15■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC32,15■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,15■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC32,14■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,74
SphkapQ6NSW3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,14■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,13■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,13■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,13■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32,12■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,12■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32,11■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,11■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC32,1■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC32,1■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,1■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC32,09■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32,09■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,09■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32,08■■■□□ 2,73
SphkapQ6NSW3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC32,07■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32,06■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,05■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32,05■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32,04■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,04■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32,04■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32,03■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32,03■■■□□ 2,72
SphkapQ6NSW3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,02■■■□□ 2,72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14,4 ms