Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Pdcd11Q6NS46 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Pdcd11Q6NS46 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Pdcd11Q6NS46 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Pdcd11Q6NS46 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Pdcd11Q6NS46 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 168.6 ms