Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc66Q6NS45 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.56
Ccdc66Q6NS45 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ccdc66Q6NS45 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc66Q6NS45 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms