Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Hecw2Q6I6G8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Hecw2Q6I6G8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Hecw2Q6I6G8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Hecw2Q6I6G8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms