Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Carmil1Q6EDY6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Carmil1Q6EDY6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Carmil1Q6EDY6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
Carmil1Q6EDY6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms