Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFZ1

Gbf1, Golgi-specific brefeldin A-resistance factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbf1Q6DFZ1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbf1Q6DFZ1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gbf1Q6DFZ1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gbf1Q6DFZ1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gbf1Q6DFZ1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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