Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ltn1Q6A009 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Ltn1Q6A009 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Ltn1Q6A009 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ltn1Q6A009 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms