Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pdzrn3Q69ZS0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Pdzrn3Q69ZS0 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pdzrn3Q69ZS0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pdzrn3Q69ZS0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms