Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms