Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Lrrcc1Q69ZB0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrcc1Q69ZB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrrcc1Q69ZB0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrcc1Q69ZB0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms