Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rab3ipQ68EF0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rab3ipQ68EF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
Rab3ipQ68EF0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rab3ipQ68EF0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms