Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY2

Ino80d, INO80 complex subunit D, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80dQ66JY2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ino80dQ66JY2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ino80dQ66JY2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ino80dQ66JY2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ino80dQ66JY2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms