Protein–RNA interactions for Protein: Q66JX5

Fgfr1op, FGFR1 oncogene partner, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgfr1opQ66JX5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fgfr1opQ66JX5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fgfr1opQ66JX5 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fgfr1opQ66JX5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms