Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q66JV7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q66JV7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q66JV7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q66JV7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q66JV7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q66JV7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q66JV7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q66JV7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q66JV7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q66JV7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q66JV7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q66JV7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q66JV7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q66JV7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q66JV7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Q66JV7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Q66JV7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q66JV7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q66JV7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q66JV7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q66JV7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q66JV7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Q66JV7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q66JV7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q66JV7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Q66JV7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Q66JV7 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q66JV7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q66JV7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q66JV7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q66JV7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q66JV7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q66JV7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q66JV7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q66JV7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q66JV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q66JV7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q66JV7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q66JV7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q66JV7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q66JV7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q66JV7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q66JV7 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q66JV7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Q66JV7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q66JV7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q66JV7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Q66JV7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q66JV7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q66JV7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q66JV7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q66JV7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q66JV7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q66JV7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q66JV7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q66JV7 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q66JV7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q66JV7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms