Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PtprdQ64487 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PtprdQ64487 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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PtprdQ64487 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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PtprdQ64487 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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PtprdQ64487 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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PtprdQ64487 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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PtprdQ64487 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtprdQ64487 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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PtprdQ64487 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtprdQ64487 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtprdQ64487 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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