Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gja3Q64448 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja3Q64448 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja3Q64448 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja3Q64448 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms