Protein–RNA interactions for Protein: Q640L3

Ccpg1, Cell cycle progression protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccpg1Q640L3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccpg1Q640L3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccpg1Q640L3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ccpg1Q640L3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.7 ms