Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tfe3Q64092 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Tfe3Q64092 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tfe3Q64092 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms