Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Polr2kQ63871 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Polr2kQ63871 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1787.1 ms