Protein–RNA interactions for Protein: Q62443

Nptx1, Neuronal pentraxin-1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx1Q62443 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Nptx1Q62443 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Nptx1Q62443 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Nptx1Q62443 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms