Protein–RNA interactions for Protein: Q62395

Tff3, Trefoil factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff3Q62395 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tff3Q62395 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tff3Q62395 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tff3Q62395 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms