Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ss18Q62280 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ss18Q62280 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ss18Q62280 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms