Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Sall3Q62255 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Sall3Q62255 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Sall3Q62255 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Sall3Q62255 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Sall3Q62255 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms