Protein–RNA interactions for Protein: Q62217

Sema5a, Semaphorin-5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema5aQ62217 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Sema5aQ62217 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sema5aQ62217 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sema5aQ62217 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sema5aQ62217 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms