Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ssr4Q62186 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssr4Q62186 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ssr4Q62186 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms