Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sin3bQ62141 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sin3bQ62141 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sin3bQ62141 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms