Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Odf1Q61999 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Odf1Q61999 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Odf1Q61999 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms