Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lama3Q61789 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lama3Q61789 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lama3Q61789 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lama3Q61789 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms