Protein–RNA interactions for Protein: Q61644

Pacsin1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, mousemouse

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Length 441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin1Q61644 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pacsin1Q61644 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pacsin1Q61644 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pacsin1Q61644 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pacsin1Q61644 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
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