Protein–RNA interactions for Protein: Q61553

Fscn1, Fascin, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn1Q61553 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fscn1Q61553 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fscn1Q61553 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fscn1Q61553 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fscn1Q61553 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Fscn1Q61553 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fscn1Q61553 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
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Fscn1Q61553 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Fscn1Q61553 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fscn1Q61553 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms