Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rad21Q61550 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad21Q61550 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad21Q61550 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad21Q61550 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad21Q61550 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rad21Q61550 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Rad21Q61550 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Rad21Q61550 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Rad21Q61550 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms