Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BcanQ61361 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BcanQ61361 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BcanQ61361 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BcanQ61361 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BcanQ61361 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BcanQ61361 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BcanQ61361 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
BcanQ61361 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BcanQ61361 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
BcanQ61361 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BcanQ61361 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BcanQ61361 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcanQ61361 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
BcanQ61361 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BcanQ61361 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BcanQ61361 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BcanQ61361 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BcanQ61361 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
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