Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Lamb3Q61087 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Lamb3Q61087 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lamb3Q61087 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms