Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxg1Q60987 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Foxg1Q60987 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Foxg1Q60987 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms