Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Klf3Q60980 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klf3Q60980 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Klf3Q60980 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.6 ms