Protein–RNA interactions for Protein: Q60973

Rbbp7, Histone-binding protein RBBP7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp7Q60973 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rbbp7Q60973 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rbbp7Q60973 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rbbp7Q60973 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167.4 ms