Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rbbp4Q60972 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp4Q60972 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Rbbp4Q60972 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms