Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbpQ60925 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
DbpQ60925 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbpQ60925 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DbpQ60925 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DbpQ60925 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DbpQ60925 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DbpQ60925 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DbpQ60925 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DbpQ60925 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
DbpQ60925 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166 ms