Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Satb1Q60611 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Satb1Q60611 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Satb1Q60611 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms