Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CttnQ60598 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CttnQ60598 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CttnQ60598 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CttnQ60598 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CttnQ60598 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CttnQ60598 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CttnQ60598 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CttnQ60598 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CttnQ60598 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms