Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4H9

Ncoa4, Nuclear receptor coactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa4Q5U4H9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Ncoa4Q5U4H9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Ncoa4Q5U4H9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ncoa4Q5U4H9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ncoa4Q5U4H9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms