Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Fam71bQ5STT6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Fam71bQ5STT6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Fam71bQ5STT6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Fam71bQ5STT6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms