Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Fam46cQ5SSF7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fam46cQ5SSF7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam46cQ5SSF7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms