Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP45

5730522E02Rik, RIKEN cDNA 5730522E02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730522E02RikQ5SP45 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
5730522E02RikQ5SP45 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
5730522E02RikQ5SP45 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
5730522E02RikQ5SP45 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms