Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJF7

Cacna2d4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d4Q5RJF7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cacna2d4Q5RJF7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cacna2d4Q5RJF7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cacna2d4Q5RJF7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms