Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Kdm6bQ5NCY0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Kdm6bQ5NCY0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Kdm6bQ5NCY0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Kdm6bQ5NCY0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.4 ms