Protein–RNA interactions for Protein: Q5ISE2

Zfp36l3, mRNA decay activator protein ZFP36L3, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l3Q5ISE2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Zfp36l3Q5ISE2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Zfp36l3Q5ISE2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Zfp36l3Q5ISE2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Zfp36l3Q5ISE2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms