Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Frem3Q5H8B9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Frem3Q5H8B9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Frem3Q5H8B9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms