Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU41

Lrrc8b, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8B, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8bQ5DU41 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lrrc8bQ5DU41 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lrrc8bQ5DU41 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lrrc8bQ5DU41 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Lrrc8bQ5DU41 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms